После эксгумации и оформления протоколов и актов, в которых фиксируются результаты, останки укладываются в контейнер (гроб, полиэтиленовый мешок). Контейнер хорошо закрывается, опечатывается, и на нем проставляется номер, который заносится в протокол. Если на раскопе нет возможности сразу составить протокол эксгумации, то оформляется его черновой вариант или делается запись в журнале раскопок.

До захоронения останков следует обеспечить полное оформление документов по эксгумации.

Захоронение останков погибших защитников Отечества, обнаруженных в ходе поисковой работы, организуется через местные органы власти и управления с отданием воинских почестей. Организованное захоронение необходимо зарегистрировать через военный комиссариат и органы местной власти и управления. Перенесенные захоронения также подлежат обязательной регистрации.

Если по каким либо причинам нет возможности провести захоронение останков сразу по окончании всех поисковых работ, организуется временное хранение останков. Место временного хранения останков фиксируется в протоколе эксгумации. Останки должны храниться в защищенном от солнца и осадков месте.

Перезахоронение останков в обязательном порядке должно быть документально зафиксировано в местных органах власти и управления, а также в протоколе эксгумации. Осуществление этих мероприятий, в том числе и переучет погибших защитников Отечества в Центральном архиве Министерства Обороны РФ, производится лицами, проводившими эксгумацию и перезахоронение.